ATP生物發光法的應用范圍十分廣泛，現已應用于食品行業的多個領域。研究表明，ATP生物發光法與標準的細菌培養菌落計數法相比，二者具有良好的相關性（r=0.98） [7] ，但怎樣細分細菌種類有一定的難度,還需要做大量的工作。利用這種方法可以對食品原料、肉類、水產品、蔬菜、飲料、酒類、酸奶等中微生物的含量進行定量。此外，采用ATP生物發光法可快速、簡便地檢測食品生產環境的清潔度。對ATP 含量的檢測是以相對發光值（Relative Light Unit ,簡稱RLU）表示的。隨著RLU值的降低，微生物的檢出幾率也降低。實驗證明：如果將RLU值以100～1000作為界限，RLU值不滿100時，微生物檢出幾率為0，RLU值在100～1000范圍內時，微生物檢出幾率為30%，RLU值超過1000時，微生物檢出幾率為96%。根據這一結果，在日常對食品生產設備或與食品密切接觸設備清潔度的檢測時，可以將RLU值不滿100時視為安全，RLU值在100～1000范圍內時視為要引以重視和注意，RLU值超過1000時視為處于微生物污染的危險狀態[8] ，因此ATP 生物發光法十分適合HACCP系統的清潔度檢測。此外，還可以用于酵母菌等對毒素的敏感性比較[9] 。近年來，ATP生物發光技術在國內外倍受推崇，在美、日等國食品行業的質量檢測控制領域廣泛應用，有效促進食品生產企業提高生產效率和經濟效益，隨著此方法不斷改進和完善，生物發光法可望發展成為一種較為理想的微生物檢測方法而得到更廣泛的應用，以不斷提高產品質量，確保食品質量安全。